Theo dự thảo đề án, đến năm 2025, mô hình Tổng c??ng ty ĐSVN sau khi sắp xếp lại gồm: c??ng ty mẹ - Tổng c??ng ty ĐSVN là c??ng ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên do Nhà nước nắm giữ 100% vốn điều lệ. Tổng c??ng ty ĐSVN sẽ hợp nhất C??ng ty Cổ phần Vận tải đường sắt Hà Nội và C??ng ty Cổ phần Vận tải đường sắt Sài Gòn. Tổng c??ng ty ĐSVN dự kiến nắm hơn 80% vốn điều lệ.

Sau khi c??ng ty vận tải đường sắt hợp nhất đi vào hoạt động, Tổng c??ng ty ĐSVN sẽ nghi??n cứu giảm tỷ lệ vốn chi phối tại c??ng ty này nhằm tách bạch hoạt động điều hành và hoạt động vận tải, tạo điều kiện để nhà đầu tư mới tham gia thị trường vận tải đường sắt. Đồng thời, Tổng c??ng ty ĐSVN sẽ nghi??n cứu hình thành c??ng ty con thuộc c??ng ty vận tải hợp nhất chuyên kinh doanh vận tải hàng hóa nhằm chuyên môn hóa vận tải hàng h??a, v???n tải hành khách.

Tại tờ trình, Ủy ban Quản lý vốn nhà nước tại doanh nghiệp cũng đề xuất Tổng c??ng ty ĐSVN sẽ giữ nguyên tỷ lệ phần vốn nhà nước nắm giữ trên vốn điều lệ của C??ng ty cổ phần Xe lửa Dĩ An là 86,85% và C??ng ty cổ phần Xe lửa Gia Lâm là 77,37%; giữ nguyên mô hình tổ chức và duy trì tỷ lệ phần vốn góp trên 51% vốn điều lệ đối với 15 c??ng ty cổ phần đường sắt và 5 c??ng ty cổ phần thông tin tín hiệu đường sắt…